Motis est né de l'initiative d'Emmanuel Tissot, multi-instrumentiste et au background relativement éclectique (du rock progressif de Blue Moon, à la chanson des Wagons De Queue en passant par le jazz de Madjarocka ou le rock indépendant des Coprins). Seul, il travaille durant un an sur des chansons médiévales et le résultat verra le jour en 2000 et s'intitulera A chacun son graal. C'est donc le premier disque de Motis. Il s'associe ensuite à Rémy Diaz (batteur et percussionniste), également musiciens depuis plusieurs années au sein de diverses formations locales (Flying Ravachol, Art Of Oil And The Nazes, Titi Racoon, ...). Le duo donne alors plusieurs concerts à travers la France (aussi bien dans leur berceau qu'est le Haut-Jura qu'à la Journée Cactus Musiques dans l'Aube ou à Lyon avec Weepers Circus). Transversal dans son approche temporelle (lier musique du Moyen-Âge et moderne comme chanson, folk et rock, à des textes d'inspiration médiévale), le groupe n'hésite pas à employer une large gamme d'instruments : guitare, mandoline, bouzouki, cornemuse, taurus, batterie, grelots. Le groupe utilise aussi des instruments venus d'ailleurs comme tabla, derbouka, djembé ou gong. En 2001, Motis sort un deuxième album studio La fête des fous et Première veillée, un album live.
Puis, en 2003, le groupe participe à plusieurs festivals (Festival International de Musique Universitaire, Festival Massif Celtrad, Festival Interceltique de Lorient, ...), recrute Florent Tissot (le frère d'Emmanuel) à la flûte traversière et sort un deuxième album live Dansons (soit le quatrième opus du groupe).
L'année suivante, les jurassiens ont l'occasion de partager la scène avec Ange, groupe vénéré par les membres de Motis. C'est ainsi que La dame et le dragon, album live capté lors de la prestation de Motis en première partie de Ange le 19 mars. Toujours en 2004, le groupe signe sur le label Musea Records (distribution de King Crimson, Malicorne, Jethro Tull, ...) et publiera un nouvel opus studio Prince des hauteurs. L'album est très bien accueilli par la presse spécialisée (nationale et internationale) et sera même distribué au Japon en 2005. Le groupe part pour une tournée française tout en passant par la Suisse et la Belgique.
Durant le deuxième semestre 2006, le groupe enregistre à la maison un nouvel album studio (L'homme-loup), qui est masterisé au Studio Dyam et sort en janvier 2007 à nouveau chez Musea Records.